Το 3ο Γυμνάσιο άρχισε να λειτουργεί στην πόλη της Ορεστιάδας κατά το σχολικό έτος 1988 – 1989. Αρχικά, εγκαταστάθηκε στο κτίριο της Μητροπόλεως ( πρώην οικοτροφείο θηλέων ), ενώ από τον Σεπτέμβριο του 1999 στεγάζεται σε κτίριο νεοαναγερθέν με τη μέθοδο της προκατασκευής, το οποίο βρίσκεται ανατολικά του Κέντρου Υγείας Ορεστιάδας.